BISC Global breidt Online Pipeline Platform (OP²) verder uit
OP² ™ stroomlijnt en automatiseert transformatie van ruwe data naar interpreteerbare resultaten.
Gent, 1 augustus 2021 – BISC Global, de consultancy voor bioinformatica, breidt zijn OP²-platform verder uit.
‘Er worden steeds meer data gegenereerd, sneller dan ooit tevoren. Hierdoor is data-analyse een belangrijke flessenhals geworden in het moleculairbiologisch onderzoek. Met de uitbreiding van OP² willen we onderzoekers nog beter helpen om deze horde te nemen’, aldus Jan Ghyssaert, COO van BISC Global.
OP² is een online platform waarmee onderzoekers heel eenvoudig data kunnen uploaden om een groot aantal pijplijnen voor bioinformatica-analyse uit te voeren, zonder dat ze zelf over specifieke bioinformatica-expertise of infrastructuur hoeven te beschikken. Het oorspronkelijke platform werd uitgebracht met twee verschillende analysepijplijnen, één voor bulk-RNA-sequencing en één voor single-cell-RNA-sequencing. BISC Global heeft nu pijplijnen toegevoegd voor kiembaan- en somatische genomica, die mogelijkheden bieden voor gerichte genoomanalyse en analyse van het volledige exoom of genoom.
Onze OP²-genomica-pijplijn is een bioinformaticaworkflow voor gerichte, genoom- en exoomanalyse van DNA-sequencingdata. Voortaan kunt u uw DNA-sequencingdata analyseren met deze analysepijplijn, de gouden standaard op dit gebied. U krijgt inzicht in de kwaliteit van uw data en u kunt kleine tot grote nucleotide- en structuurvarianten identificeren en annoteren met biologische informatie.
De workflow verwerkt ruwe data van FastQ-inputs en verzorgt het uitlijnen van de reads en het identificeren en annoteren van de varianten. U ontvangt deze resultaten in de vorm van twee interactieve rapporten plus een compleet gegevenspakket met alle benodigde tussenliggende bestanden voor diepgaande data-analyse. De pre-processing workflow vertaalt uw ruwe sequencingdata naar uitgelijnde gegevens die aan de kwaliteitsnormen voldoen. Vervolgens kunt u met de post-processingworkflow de biologische betekenis van uw gegevens beoordelen aan de hand van de annotaties bij de data.
Maarten Braspenning, CEO van BISC Global: ‘We zijn heel tevreden met de uitbreiding van OP². Dankzij dit platform kunnen onderzoekers bij bedrijven en universiteiten hun sequencingdata met één druk op de knop analyseren. Het eenvoudige prijsmodel is gebaseerd op het aantal geanalyseerde monsters. Het platform is toegankelijk voor alle onderzoekers, ongeacht hun bioinformatica-expertise en de servers of cloudinfrastructuren waarover ze beschikken. Daarmee maakt OP² het voor onderzoekers een stuk gemakkelijker om hun gegevens snel te analyseren.’
BISC Global, opgericht in 2017, behoort inmiddels tot de top 10 bioinformatica-consultancy- en dienstverleningsbedrijven en is leverancier van de grootste ondernemingen ter wereld op het gebied van farmaceutica en biotechnologie. Vanuit vestigingen in Gent, Amsterdam, Basel, Boston en San Francisco levert BISC Global on-premise of cloudgebaseerde oplossingen voor data-analyse en ontwikkeling van speciale tools en pijplijnen. Met ons wereldwijde personeelsbestand van gespecialiseerde consultants ondersteunen we data-analyse in verschillende vakgebieden, uiteenlopend van machinelearning (data-mining, patroonherkenning, beeldanalyse, (on)begeleid leren, neurale netwerken, deep learning) en bio-informatica (transcriptomica, metabolomica, metagenomica en epigenomica op celniveau) tot statistiek (experimentenontwerp, wiskundige modellering, signaal/ruis-optimalisatie en kruisvalidatie van onafhankelijke data).
Ga voor meer informatie naar www.biscglobal.com of stuur een e-mail naar info@biscglobal.com.
